La devoción al Cristo de la Misericordia comenzó en la capilla de San Andrés (actual iglesia antigua del Stmo. Cristo de la Misericordia), donde los fieles veneraban un antiguo lienzo de un Cristo crucificado que ocupaba uno de los altares laterales. Con el tiempo, esa imagen fue reemplazada por tres tallas distintas, cada una dejando su huella en la historia de la Hermandad.

La primera imagen, creada en 1723, marcó un momento importante para la Hermandad, aunque poco se sabe de su origen: ni el autor ni el estilo artístico han llegado a nuestros días, y lo único que permanece como testimonio es un grabado.

A comienzos del siglo XX, fue esculpida la segunda imagen en estilo barroco por Melitón Comes (1871-1940). Esta nueva talla llegó gracias a la donación del primer párroco de la recién fundada Parroquia del Santísimo Cristo de la Misericordia en 1904, tras su separación de la Parroquia de la Asunción. Desafortunadamente, esta obra fue destruida durante la Guerra Civil, cuando la iglesia sufrió su saqueo y profanación.

Finalmente, en 1941, tras la Guerra Civil, la Hermandad adquirió la tercera imagen, que es la que actualmente se venera. Esta talla, atribuida al escultor madrileño Tomás Parés Pérez (1914-1996).